BPPT menggunakan KR Baruna Jaya I dalam pencarian black box Lion Air PK-LQP. KR Baruna Jaya I menggunakan berbagai peralatan dalam pencarian Lion Air PK-LQP. Keberhasilan BPPT mendapatkan FDR dari Lion Air PK-LQP merupakan hasil kerja sama berbagai instansi yang terlibat dalam pencarian.
Sebelumnya, tim SAR gabungan berhasil menemukan bagian kotak hitam pesawat Lion Air PK-LQP pada Kamis, 1 November 2018 pagi. Bagian kotak hitam dibawa menggunakan kotak khusus dan tetap direndam dengan air laut untuk hindari kerusakan perekaman FDR Lion Air PK-LQP. Bagian FDR merekam bagaimana data penerbangan pesawat selama 25 jam terakhir.