Kecaman terhadap pembatasan masuk ke Masjid Al-Aqsa juga datang dari tanah air. Pemerintah indonesia mengecam keras kebijakan pembatasan tersebut. Hal ini disampaikan Presiden Joko Widodo saat berkunjung ke Universitas Ahmad Dahlan, Bantul, Yogyakarta. Atas krisis yang terjadi, presiden joko widodo juga meminta perserikatan bangsa-bangsa agar segera menggelar sidang untuk mengakhiri konflik yang terjadi.