Montré du doigt de son vivant dans plusieurs pays arabes, Mohammed Arkoun dérangeait.. il invitait à une relecture du Coran à la lumière de la science, passant le religieux au crible de la raison critique.. il se démarqua vite de l'islamologie classique en proposant l'islamologie appliquée.. Une nouvelle discipline qu'il a initié grâce à ses travaux de "chercheur-penseur-enseignant" accumulés sur plus de 30 ans de recherche pluridisciplinaire.. il ne développe pas une pensée contre ou autre que la religion, mais une pensée autre de la religion..