Quando o nível de acidentes de trabalho começa a aumentar na Baía de Tóquio, os detetives de polícia Kusumi e Hata são designados para investigar. O que eles descobrem leva a uma série de encobrimentos do governo, conspiração sobre uma nova arma biológica intitulada WXIII-Wasted Thirteen e uma trágica conexão pessoal com Hata. A única esperança de impedir essa ameaça é cooperar com os militares e liderar o WXIII em um confronto com os Trabalhos da Divisão de Veículos Especiais 2.