La fonction publique est dans le viseur de la Cour des comptes.
En 2014, on comptabilisait 10 jours d'arrêt maladie en moyenne par agent, contre 12 en 2019.  En cause, selon le Medef, des conditions d'accès à l'arrêt maladie peu contraignantes. Cette progression a également été observée dans la fonction publique hospitalière. Elle s'explique, en grande partie, par les conditions de travail des soignants. Le montant total des arrêts maladies représente 11,9 milliards d'euros de rémunérations brutes par an. Dans ses recommandations, la Cour des comptes propose notamment de renforcer les contrôles et la prévention dans les entreprises publiques.