La Gironde a été épargnée lors de la première vague du Covid-19. Mais depuis une semaine, la seconde vague frappe fortement le département. Pour preuve, la courbe des personnes testées positives est en hausse. Au 6 septembre, on dénombrait 9,8 % de personnes testées positives contre 1,3 % au 6 août. Les hospitalisations au CHU de Bordeaux ont doublé en une semaine. Au 10 septembre, on y comptabilise 98 personnes hospitalisées. Bordeaux est la ville la plus touchée du département, avec un taux d'incidence de 470 pour 100 000 habitants, chez des individus qui ont entre 18 et 40 ans.
Dans la région Nouvelle-Aquitaine, 85 clusters ou foyers de contaminations ont été détectés, dont 44 en Gironde. Face à cette accélération du virus, la préfecture de Gironde a fermé plusieurs bars et restaurants.