Louis Aliot n'est pas d'accord avec le projet du gouvernement de retoucher la loi de 1905 pour inciter les communautés musulmanes à adopter le statut d'associations cultuelles, Evoquant "certains principes de certaines religions qui sont contraires à nos lois" il affirme, au sujet de la laïcité : "Cet édifice s'est construit lentement, on est arrivé à un équilibre. Ce n'est pas à la république de s'adapter c'est à la religion."