Dans un laboratoire de l'Institut Pasteur à Paris, huit chercheurs cultivent et manipulent des bactéries pour mieux les comprendre et déceler leurs faiblesses. David Bikard, le directeur, souhaite lutter contre la résistance des bactéries aux antibiotiques. Sa collègue, Florence Depardieu, a récemment découvert que ces microscopiques invités incongrus se suicidaient lorsqu'ils rencontraient certains types de virus.