Historia posterior y naufragio[editar]
La nave recuperada fue utilizada durante doce años por distintos propietarios.

En enero de 1885 fue cargado en exceso con chatarra, incluyendo botas y comida para gatos, por su capitán, quién intentó hundirlo para reclamar la póliza del seguro. El plan no funcionó y una investigación por parte de la aseguradora reveló el fraude.
Luego de este suceso la carrera del Mary Celeste fue muy ajetreada. Fue vendido muchas veces y siempre por un precio inferior al del mercado, ya que era difícil encontrar tripulación para un barco embrujado. Su último viaje fue de Boston a Haití en 1884, encallando el 3 de Enero de 1885en la escollera de Roshel, en aguas de la costa de Haití. En la investigación posterior se demostró que el capitán Parker, el cónsul americano en Haití y los expedicionarios, estaban de acuerdo para estafar a la compañía aseguradora. Parker había llevado al "Mary Celeste" a los escollos deliberadamente; no obstante fue absuelto gracias a una formalidad burocrática, y murió antes de que se instituyese un nuevo proceso.
El 9 de agosto de 2001, una expedición encabezada por Clive Cussler (Representante de la Agencia Nacional Marina y Submarina) (NUMA en inglés) y el productor canadiense John Davis anunciaron que habían hallado los restos del navío en la isla de la Gonâve, Haití. El arqueólogo James P. Delgado identificó los restos como los del Mary Celeste.